Die Thüringer Allianz-Hochschulen kooperieren in zahlreichen weiteren Netzwerken:
Netzwerk Hochschulmarketing in Thüringen
Thüringer Hochschulgründernetzwerk
Thüringer Koordinierungsstelle Naturwissenschaft und Technik
Thüringer Netzwerk für Kooperative Promotionen
IT-Zentrum der Thüringer Hochschulen